牛津大学医学科学部（Medical Sciences Division）开设有以下18个学系、研究所或研究中心，包括：
博士培训中心（Doctoral Training Centre）
生物化学系（Department of Biochemistry）
临床医学系（Department of Clinical Medicine）
临床神经科学系（Department of Clinical Neurosciences）
实验心理学系（Department of Experimental Psychology）
神经科学项目（Neuroscience）
妇产系（Department of Obstetrics and Gynaecology）
肿瘤系（Department of Oncology）
骨科、风湿与肌肉骨骼科学系（Department of Orthopaedics, Rheumatology and Musculoskeletal Sciences）
儿科系（Department of Paediatrics）
病理学院（School of Pathology）
药理学系（Department of Pharmacology）
生理学、解剖学与遗传学系（Department of Physiology, Anatomy and Genetics）
人口卫生系（Department of Population Health）
基础医疗卫生科学系（Department of Primary Care Health Sciences）
精神病学系（Department of Psychiatry）
拉德克利夫医学系（Radcliffe Department of Medicine）
外科科学学系（Department of Surgical Sciences）
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